Jezioro Biskupińskie położone jest w województwie kujawsko-pomorskim, w gminie Żnin. Połączone jest ono bezpośrednio z Jeziorem Skrzynka. Jego powierzchnia wynosi 1,17 km2. Maksymalna głębokość zbiornika to 13,7 m. 

Zgodnie z badaniami przeprowadzonymi w 2004 roku, zbiornik zaliczono do wód pozaklasowych oraz do III kategorii podatności na degradację.

Nad jeziorem znajduje się muzeum archeologiczne w Biskupinie.