Kościół pw. św. Andrzeja Boboli został wzniesiony na początku XX wieku. Budowa trwała od 1913 do 1916 roku. Na uroczystości poświęcenia świątynia obecny był następca tronu niemieckiego Wilhelm wraz z małżonką Cecylią. Ufundowała ona wiele sprzętów kościelnych, w tym chrzcielnicę i Pisma Święte.

Na tle innych protestanckich kościołów ten w Gdańsku jest wyjątkowy. Wybudowano go bowiem w stylu neobarokowym, gdy tymczasem popularnością cieszył się neogotyk. Ówczesny wystrój kościoła odbiegał od obecnego – brakowało oczywiście wizerunków świętych, ściany utrzymane były w tonacji białej i szarej, natomiast wyróżniały się detale architektoniczne, które były czerwone, matowoniebieskie, ciemnozielone i brązowe. Teraz niewiele pozostało z dawnego wnętrza. Do naszych czasów zachowały się jednak oryginalne organy.

Jezuici przejęli kościół w 1945 roku. Teraz jest on główną świątynią parafii św. Krzyża, obejmującą dużą część Dolnego Wrzeszcza.

Godziny odprawiania Mszy św.:
niedziele i święta 6:30, 8:00, 9:30, 11:00, 13:00 (suma), 19:00 (akademicka)
dni powszednie 6:30, 7:30, 8:30, 19:00