Kościół od II poł XIII wieku do początku XIX związany był z praskimi zakonnikami św. Augustyna, którzy nazywani byli "Markami" od imienia patrona świątyni. Prawdopodobnie został on ufundowany przez księcia Bolesława Wstydliwego w 1263 roku.

Budowę rozpoczęto w II poł XIII wieku i kontynuowano w wieku XIV i XV. 

W 1494 roku kościół uległ zniszczeniu w  wyniku pożaru z którego ocalały jedynie mury jego prezbiterium, następnie odbudowany przez społeczeństwo, znów ulegał pożarom w 1528 i 1589 roku. W XVII wieku dokonywano powolnej odbudowy kościoła, zmodernizowano jego wnętrze, jednak już w 1724 roku kolejny raz wybuchł tu pożar. W 1807 roku kiedy rząd austriacki skasował klasztor, stworzono tu dom księży emerytów. W latach 1972-74 świątynia została poddana gruntownej restauracji. 

W jej wnętrzu na szczególna uwagę zasługuje gotycki krzyż z Chrystusem, figura Matko Boskiej Bolesnej, św. Jana Ewangelisty, kaplica Matko Boskiej Częstochowskiej oraz jej cudowny obraz oraz wiele innych zabytków.

Msze święte:
W niedziele i święta – 9:00 (od IX do VI), 10:15, 11:30, 15:30.
W dni powszednie -  12:30, 18:30 (od IX do VI).